修改的主要内容包括五个方面：在取消行政审批事项方面，通过修改放射性药品管理办法等22部行政法规的68个条款，取消了放射性药品经营审批等34项审批项目；在取消行政审批中介服务事项方面，通过修改地震安全性评价管理条例等2部行政法规的4个条款，取消、规范了建设工程场地地震安全性评价等2项行政审批中介服务。在取消职业资格事项方面，通过修改招标投标法实施条例等10部行政法规的27个条款，取消了招标师执业资格等10项职业资格。在企业投资项目核准前置审批改革方面，通过修改公共机构节能条例等5部行政法规的7个条款，将建设项目节能评估和审查等9项企业投资项目核准前置审批改为与项目核准并联办理。在加强后续监管方面，强化了有关部门对行政审批项目取消后从事相关活动的监管。
其中，《决定》明确，将《中华人民共和国招标投标法实施条例》第十二条修改为：“招标代理机构应当拥有一定数量的具备编制招标文件、组织评标等相应能力的专业人员。”删去第七十八条：“取得招标职业资格的专业人员违反国家有关规定办理招标业务的，责令改正，给予警告；情节严重的，暂停一定期限内从事招标业务；情节特别严重的，取消招标职业资格。”将《公共机构节能条例》第二十条第二款修改为：“国务院和县级以上地方各级人民政府负责审批固定资产投资项目的部门，应当严格控制公共机构建设项目的建设规模和标准，统筹兼顾节能投资和效益，对建设项目进行节能评估和审查，未通过节能评估和审查的项目，不得开工建设；政府投资项目未通过节能评估和审查的，依法负责项目审批的部门不得批准建设。”删去第三十九条第一款中的“或者核准”。
同时，废止了城乡集市贸易管理办法、工资基金暂行管理办法、国家体育锻炼标准施行办法3部行政法规。这3部行政法规有的是主要内容已被有关法律、行政法规替代；有的是规定的职责已经取消，有关内容已有新规定；有的是适应当时情况的具体规定，目前实际已不再适用。
